本校創立於民國7年4月,係由嘉義公學校分出,校名為「嘉義簡易商業學校」,校址位於垂楊路現今之「崇文國民學校」,校長由公學校校長江口保兼任。民國11年3月更名為「嘉義簡易商工學校」,增設工科,校址位於原嘉義廳舍邊,由小泉順接任校長。民國14年3月更名為「嘉義商工補習學校」。民國17年3月由小野邦彥接任校長。民國18年5月由井上德造接任校長。民國21年3月更名為「嘉義商工專修學校」,校舍三遷至林森路「省立工業學校分部」內。民國30年與工科分別設校,更名為「嘉義專修商業學校」。民國31年6月校長改由柚木滿彥接任,校址四遷至民族路現今之「民族國民學校」左鄰。民國33年校舍被炸,又遷回「省立工業學校分部」上課,光復前,校址搬遷共5次,日籍校長計有5人。
民國34年11月,台灣光復後,校長由「嘉義專修工業學校」校長莊君地兼任。民國35年3月改制為「嘉義市立初級商業職業學校」,校長由市教育科長郭祖繩兼任,4月校址勘定現址,12月由張源泉先生接任校長。民國39年10月為弘揚校友華南銀行董事長劉啟光先生捐資興學,奉准更名為「嘉義縣立華南初級商業職業學校」。民國43年8月奉准試辦高級部。民國44年7月成立民雄分部,借用民雄國校教室上課。民國45年8月奉准改為完全職業學校,更名為「嘉義縣立華南商業職業學校」。民國53年4月民雄分部奉准獨立設校,校名為「嘉義縣立民雄初級中學」。
民國57年8月改制為省立,校名為「臺灣省立華南商業職業學校」,並停招初級部。民國59年8月奉令更名為「臺灣省立華南高級商業職業學校」。民國62年8月開辦會計統計、文書事務、廣告設計等三科。民國63年10月張校長病逝,11月省派殷其藻校長接任。民國65年7月停辦文書事務科。民國69年8月殷校長調職,省派劉智校長接任。民國77年2月劉校長榮退,省派蔡德連校長接任。民國77年8月綜合商業科改為商業經營科,會計統計科改為會計事務科,並增設資料處理科。民國84年8月蔡校長調職,省派何瑞仁校長接任。民國88年2月何校長榮退,省派沈豐茂校長接任,8月增設應用外語科英文組。
民國89年2月奉令改制為國立,校名為「國立華南高級商業職業學校」。90年8月停招會計事務科,增設國際貿易科。民國92年2月沈校長榮退,教育部遴派黃義春校長接任。93年8月開辦綜合高中,開創校史新紀元。98年8月黃義春校長調職,教育部遴派柯朝塗校長接任。106年8月柯朝塗校長調職,教育部遴派孫忠義校長接任。
民國102年8月停招資料處理科,增設電子商務科。103年8月增設觀光事業科。民國105年8月增設高中普通科,停招綜合高中。
本校現有商業經營科、廣告設計科、國際貿易科、應用英語科、電子商務科、觀光事業科及高中普通科等7科,計42班。
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